地表水反渗透系统的设计计算实例与以井水为给水水源相比，以地表水为给水水源的反渗透水处理系统的工艺设计和系统监控更为复杂，各种参数的选定更加保守。其原因可归为以下几个方面：
地表水中的各种悬浮物和胶体的含量较高，需要更多的预处理；市政水处理或反渗透预处理过程中往往引入了反渗透系统的污染物 ( 如明矾、阳离子、聚合物电解质、正磷酸锌及活性碳微粒等 ) ，有机污染物以及微生物、藻类等生物活性较高的特质