河道管理涉及的内容十分广泛，防洪、采砂以及行政许可很多法律都有有关河道管理和保护的内容。修订河道管理条例时注意与其他法律法规的关系，作到与其他法律法规相协调、相衔接。凡是其他法律有明确规定的，本条例不再重复，或者只作原则性、衔接性的规定；其他法律没有规定或者规定不够完善的，本条例修订中尽可能做出明确规定。
——坚持针对性和可操作性的原则
当前，河道管理工作面临的问题很多、很复杂，不可能通过修订一次条例全部予以解决，本次修订主要抓主要矛盾，力求解决突出问题。河道管理机构与职责未明确；水域占用现象突出；涉河建设项目缺乏统一规划；河道内依法行政尚不到位，监督管理和保障还有所欠缺，这些都是此次修订力求解决的重点。
——总结河道管理实践，把成熟的政策上升为法律的原则
条例实施十多年来，各地积累了很多好经验和好做法。一些地方实施河道规划制度，加强对涉河建设项目的统一管理和审批；推行水域占用补偿机制，加强对河道资源的保护；明确河道管理机构的职责；强化河道管理的保障。对这些经验进行认真总结，把成熟的、带有普遍性的经验上升为法规。