本项目所在地区处北回归线以南，濒临南海，具有热带、副热带季风气候的特征，同时具有海洋性气候色彩。总的情况是高温多雨，夏季多台风，冬季有寒潮。
气温：年平均气温约21°C，以7-9月气温最高，月平均气温28°C，但受海洋性天气影响，极端气温很少超过37°C；1月份最低，平均13°C以上，极端最低气温一般在0°C以上。
降水：年降水量一般为1000mm-2400mm，年平均降水天数约150天，其中雷阵雨约80天，冬季降水量较小。
雾：雾况一般出现在11月至翌年4月，全年约有10-20个雾日。
风向：夏季多为南风，偏南风，冬季多为北风，偏北风，多年平均风速约为2.4m/s.
台风：每年约3次，在5-10月影响项目区域，通常出现在7-9月份，台风时常伴有暴雨暴潮。
流量：西江百顷头-虎跳门航道是以径流为主型河流，同时也受不规则半日潮型潮汐的影响，在虎跳门水道百顷头入口处多年平均流量为2520m3/s，约占马口站平均流量的33.6％，此后沿程再经多处分流。
潮流界线：枯季由于径流量减少，潮流上溯，潮流界线在肇庆以上；洪季潮流界线在江门、外海一带。
潮位：一年中最高潮位出现在汛期，以7月份最多，最低潮位现于枯季12-3月份，以1月份最多。
洪水：洪水发生于4-9月份，以6-8月份最多，洪水历时一般为3-4天。
枯水：枯季发生在10-4月份，最枯一般在1-2月份。
3.1.2 地质、土质
3.1.2.1 地貌
虎跳门水道西侧为高平原，东侧为低平原，近口门段为丘陵夹持，并有零星残丘分布其间。
高平原，当地又称高沙田。是年代较老，围垦较早的平原，地面高程0.5－0.9m，低平原，又称低沙田，是近期围垦的平原，地面高程-0.2－0.7m。
3.1.2.2 地质
虎跳门水道包括河流两岸，则为黄杨山和古兜山之间的基岩凹地，基底起伏不平，多为砂岩、砾岩和燕山期花岗岩，埋藏较浅。
三角洲平原及河流两岸，沉积层的岩性组成较为复杂，且因地而异，这是砂同沉积环境下河相海相相互作用的结果。总的来看，沉积层的柱状综合特征，大体上可分为六组：自下而上第一组为河相沉积的底砾层；第二组为海相沉积的深灰色粘土；第三组为河相沉积的花斑粘土或砾砂层；第四组为海相沉积为主的深灰色淤泥；第五组为河相沉积为主的浅风化粘土或中粗砂层；第六组为现代河海相沉积的砂质淤泥或砂质粘土。
3.1.2.3 河床及浅滩浅地层结构
虎跳门水道河床底质以细砂、中细砂为主，局部为淤泥、粘土及硬土。颗粒明显从上游向下游变小，它们所含粗砂和粘土极少，其中值粒径比较均匀，分选性很好。泥沙主要为陆上供给，属推移质泥沙，主要来自西江。虎跳门口为现代河口沉积区，河床质为砂－粉砂－粘土的混合沉积，分选性很差，表明海洋因素有一定影响。
