综合治理工程旨在通过对流域的山、水、田、林进行综合治理，解除洪水威胁，使基础设施齐全，投资环境优良，生态环境良好，工、农业生产发展，社会经济水平提高，达到全流域“安全、生态、发展、和谐”的目标。本阶段设计文件及图纸均采用珠基高程系统。