根据建设单位的意见，空调主机选用风冷型冷热水机组。设计中将大楼分为若干个空调系统，即：1-2层公用部分为一个系统，主机设在屋面；3-12层住院病房，每层为一个独立系统，主机设在同层室外休息平台的一侧；13层手术部为一个系统，主机设在屋面；14层大会议室及休息室为一个独立系统，准备室也为一个独立系统，主机均设在屋面上。
一层大厅、收费室，二层公共空间、会议学习室、大实验室，十四层会议厅、休息厅、准备室等大空间场所设计为风管低速送风全空气系统；