本区以侏罗系上统－白垩系下统的凝灰岩、凝灰熔岩、熔结凝灰岩为主。剥蚀中、低山区构造发育，受构造影响，岩体节理、裂隙较发育；火山岩和部分花岗岩存在不均匀风化现象。
山坡的基岩裂隙水和孔隙水不发育，构造破碎带和节理裂隙密集带地下水较为发育。
隧道围岩级别一般为Ⅱ～Ⅲ，隧道进出口、浅埋、偏压地段以及构造破碎带、节理裂隙密集带为Ⅳ、Ⅴ级围岩，隧道洞身工程地质条件一般较好。青云山隧道地层岩性特征较为简单，主要为侏罗系上统南园组、白垩系下统石帽山群的火山岩、火山碎屑岩、次火山岩。此外零星分布有第四系冲洪积和坡积层。