本工程采用项目管理，成立中铁××局厦门工程处永漳公路××合同段项目部，全权负责该工程的组织、管理、协调、指挥，下设六部一室，即施技部、安质部、计统部、物资部、财会部、保障部、办公室，直辖五个专业工程队（机械土方作业队、桥梁作业一队、桥梁作业二队、路面作业队、综合作业队）；项目部设项目经理一名，总工一名，党工委书记一名，项目副经理一名，形成以项目经理、书记、总工程师、副项目经理为指挥核心的项目经理负责制。
项目经理苏凌云代表企业对工程项目全面负责；项目副经理林××分管材料机械进场及调配、施工队伍组织安排；项目技术负责人何××对项目施工技术工作全面负责，分管施工质量及安全管理；党工委书记黄××负责主持支部日常工作，分管经常性政治思想工作，协调各方面关系项目部编制定员20 人，其中技术干部10 人，行政干部2 人，其他管理人员8 人；施工队伍劳动力投入：平均200 人，施工开始及施工收尾阶段80 人，施工高峰期250 人。