项目区域气候以苏北灌溉总渠为界，以北属南温带气候。年平均气温13.6℃～14.7℃之间。其中最冷月（1月）平均气温0℃～1℃之间，最热月平均气温26.7～27.5℃。气温分布特征为南高北低，西高东低。
年降水量淮安地区为887～997mm，南部多于北部，夏季降水充沛，东部地区受梅雨及台风影响，占全年降水量的54%～56%，冬季雨量较少。
区域内主导风，冬季以北风为主，夏季以东南风为主，年平均风速2.9～3.9m/s。
区域内地处淮河中下游水系和里下河地区的中北部，暴雨、洪涝等灾害性天气频繁，盐城东部地区受海洋性气候影响，台风、龙卷风、冰雹等灾害性天气每年有2-3次，对工程实施有一定影响。
