为地下二层车站，岛式站台，主体结构为地下二层两柱三跨钢筋混凝土箱形框架结构。主体结构受力体系由侧墙、立柱、纵梁和楼板等构件组成。车站结构布置采用纵梁体系，楼板的横向最大跨度为12.0m。车站侧墙由地下连续墙围护和内衬墙结构共同受力组成。
威宁路站全长373.054m，可分为车站中部的站厅站台段和两端的设备用房段，参见图1-1“威宁路站平面图”。地下一层为站厅层、地下二层为站台层，岛式站台有效长度为186.00米，宽度为10.0米。基坑深度标准段13.8m，端头井16.53m，基坑宽度标准段22.6m，端头井24.5m。
车站两端为设备及管理用房，双层结构。站厅站台段结构顶部覆土厚度约2.34m，设备用房东段覆土厚度约1.9m，车站结构在覆土厚度过渡段设置诱导缝。
