海底隧道与一般山岭隧道最显著的差异就是涌水源是无限的海水，必须止水。
根据设计资料，本隧道Ⅳ、Ⅴ级围岩开挖施工前需进行注浆止水及加固措施。
Ⅳ级围岩主要分布在断裂影响带或接近弱风化带处。岩体破碎或有软弱夹层，呈碎裂结构或硬岩夹软岩的松软结构，渗透性较好，掌子面常会出现泉涌状出水，水压大时可发生大的变形破坏。隧道开挖时，一般采用超前小导管注浆和钢拱架支撑相结合等综合支护措施。
Ⅴ级围岩主要为构造破碎带或类似强风化等散体状岩体，无自稳能力，隧道开挖采用超前管棚、超前小导管加钢拱架支护预支护措施，海域段采用超前帷幕注浆止水、加固措施。
