软岩对隧道施工过程中隧道的稳定性有很大的影响，因此隧道施工过程中的开挖和支护方法很重要，本设计针对软岩和两水隧道本身的特点，采用钻爆法施工，三台阶法开挖断面，从开挖到支护完成的整个过程，充分体现“新奥法”的精髓，以保证隧道本身的稳定性。
根据“新奥法”施工的要求，文中进行了以下设计，主要内容包括：隧道衬砌结构设计、隧道二次衬砌的结构计算以及施工组织设计，施工组织过程中又针对开挖和支护方法进行了详细的说明，对施工过程中遇到的不良地质地段，提出了相应措施，同时对隧道的施工辅助作业进行了简要设计。
两水隧道的衬砌结构采用复合式衬砌，断面形式为曲墙拱形断面，预留变形量为35cm，初期支护采用锚、喷、网联合支护结构，二次衬砌厚度为60cm，主筋采用5Φ22，纵向连接筋采用Φ14，箍筋采用Φ8。