本区属中亚热带季风气候，其主要特点是寒暑差异不大，雨旱两季分明。10月至次年5月为旱季，气候干爽，冬春多季风，蒸发量大，6~9月为雨季，月降雨量150~250mm，全年降雨量1040mm。雨季连续无降水日数不超过10天。由于地形的影响，安宁河谷与两岸山地气候差异比较明显，就安宁河河谷区（工程区）而论，年平均气温13℃，最高气温36.15℃，最低气温-10.7℃，气温日变化较大。多年平均相对湿度在69%左右。无霜期为236天，多年平均风速2.4m/s，最大风速20m/s，无严寒酷暑，四季不太分明，年平均日照时数约2400小时。