工程区内的地形地质条件复杂，辅助洞的主要地质问题包括岩溶水文地质、断层破碎带、高地应力与岩爆、地高地温和有害气体等。在已揭露的大水沟长探洞中已碰到了各类地质问题，有些已构成了较严重的地质灾害，尤以突水、突泥现象最为突出，涌水地点、长度及规模难以判定。工程区内地表岩溶虽不发育，但赋存有丰富的地下水，大量可溶岩地质，具备了溶洞的条件，可能会出现溶洞及突水、突泥现象。工程区域地形复杂，且赋存有丰富的地下水，由NNE、NEE、NWW向三组结构面构成了主要导水网络，在已揭露的大水沟长探洞中已碰到瞬时涌水量≥0.1m3/s的突水突泥点10处，突水点最大瞬时涌水量达4.91m3/s。